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最常见手术后并发症的并发症为脑血栓（系红细胞增多手术后并发症，血粘稠度增高手术后并发症，血流滞缓所致）、脑脓肿（细菌性血栓）及亚急性细菌性心内膜炎。
而积极接受手术治疗的患儿手术后并发症，也会并发一些术后并发症手术后并发症：
1、肺部并发症
2、完全性房室传导阻滞Ⅲ度房室传导阻滞是F4根治术后的常见并发症,由于术中直接创伤,牵拉或缝线位置不当以及术中低温,缺氧缺血等,可导致完全性房室传导阻滞,但多为一过性,
3、低心排综合征多因畸形过度复杂,手术畸形纠正不满意。
4、渗血出血F4患者由于侧支循环丰富,凝血机制障碍和体外循环间较长等致使术后渗血机会增加,
5、全身毛细血管渗漏综合征
微创外科术中的并发症有：
(1)微创外科气腹对生理功能的影响：包括酸血症、循环功能改变、呼吸功能改变、消化功能的影响、脑血流的影响、CO2栓塞、组织间或皮下气肿、气胸等。
(2)手术操作所致并发症：如胆漏、肝管损伤、血管损伤及出血、泌尿道损伤和皮肤烧伤等。
(3)需要中转开腹手术处理的并发症：文献报道中转手术率为1．5％。①病变因素：如致密粘连、癌变或发现其他脏器病变等；②技术因素：包括脏器损伤、血管损伤或难以控制的大出血等；③病人因素：病人出现人工气腹的严重并发症，高碳酸血症等；④其他因素：气腹不满意或器械故障等。
手术后并发症：
(1)肩痛，特别是右肩痛，为CO2气腹刺激膈下所致。
(2)膀痛。
(3)神经损伤。
(4)泌尿系并发症。
(5)感染。
(6)切口疝。
(7)其他。
(1)术中并发症：①作角巩膜切口时误伤晶体。②作囊外摘除时或刺囊膜时导致后囊破裂晶体半脱位或全脱位。③玻璃体脱出。多见于囊内摘除术。④囊内冷冻摘除术中误粘虹膜，导致虹膜根部裂离。⑤前房积血。⑥暴发性脉络膜下出血。
(2)术后并发症：①角巩膜缘伤口裂开，有时伴虹膜脱出。②前房积血：常见于术后3～5天。③虹膜睫状体炎。④角膜内皮水肿。⑤前房形成迟缓：术后24小时前房应形成。前房形成迟缓分为高眼压及低眼压两类。低眼压类多与伤口漏水、脉络膜脱离有关；高眼压类则可能与暴发性脉络膜下出血或恶性青光眼有关。⑥眼内感染。⑦继发性青光眼：与前房形成迟缓、虹膜睫状体炎、晶状体皮质残留过多、前房大量积血有关。⑧瞳孔上移：多见于玻璃体脱出者。⑨上皮囊肿植入前房。⑩晶状体蛋白过敏症。(11)术后散光。(12)后发性白内障。(13)黄斑囊样水肿。
手术对于患者来说既是一种治疗措施手术后并发症，又是一种损伤。且手术过程中患者需行麻醉，存在麻醉手术后并发症的风险和并发症。因此，总的来说，手术并发症可以说是可以尽量减少，但是不可避免的。肝病手术中也存在着并发症，由于肝病手术的种类繁多，包括门脉高压手术、脾切除手术、肝移植术等，其并发症必然也有不同。其常见的手术并发症有：肝功能损害、出血和感染等。
人工流产手术操作简单、时间短，按手术常规操作，是很安全可靠的。但确实也有少数孕妇由于多种原因而产生一些并发症，主要有：
1出血：人工流产手术时出血超过200毫升者称为流产时出血。这大多由于妊娠月份较大，特别是妊娠13～14周时做钳刮手术过程中子宫收缩不好、大块的胎盘组织不能及时取出、子宫及宫颈的损伤等所致。尽量避免大月份的钳刮是减少出血的关键。大月份钳刮手术应由经验丰富的医生进行。
2人工流产综合症：个别孕妇在手术过程中，特别是在用宫颈扩张器扩张宫颈内口时，突然出现面色苍白、出冷汗、胸闷、血压下降及心律紊乱、心动过缓，严重者可发生抽搐、昏厥等现象，这统称为“人工流产综合症”。轻者，停止手术后很快就恢复正常；重者，可给予氧气，或静脉内注入阿托品1毫克，一般说均能很快恢复正常。
3流产不全：少数孕妇术后阴道有不规则流血。量多且伴有血块及下腹部疼痛现象。妇科检查发现子宫颈内口松，有时可发现有血块或胎盘组织堵塞于宫颈外口，或B超检查宫腔内有组织残存。这是由于手术残留而造成的流产不全，应在用抗生素控制感染后清理官腔，刮出官腔内容物送病检。
4感染：受术者术后感到有下腹部疼痛、腰酸、白带多且伴有发热等现象。这是细菌侵入子宫内膜、输卵管等造成急性子宫内膜炎、子宫肌层炎、盆腔结缔组织炎等所致。造成感染的主要原因是无菌操作不严密，术前原有生殖道炎症未能及时发现与治疗。感染一旦发生，应及时使用抗生素以控制感染。
5子宫穿孔：子宫穿孔往往是由于手术者术前未能很好地查清楚子宫的位置，或由于宫颈内口狭窄粘连、手术者强行将探针送入子宫内造成。一旦疑有子宫穿孔发生，应停止手术，对子宫损伤处进行修补。手术应给予大剂量抗生素以控制感染的发生。
6羊水栓塞：大多发生在大月份钳刮手术时，孕妇突然感到胸闷、气急、呼吸困难等。体检可发生现孕妇颜面及全身青紫、心率变快、脉搏细弱、血压下降等。应暂时停止手术，进行抢救。
7宫颈管及宫腔粘连：人工流产术后受术者出现周期性下腹部疼痛。经量减少甚至闭经。检查发现子宫增大，B超见官腔内有积液现象，应疑有宫颈管及宫腔粘连的发生。对宫腔粘连者，可进行钝性官腔分离术。如粘连严重。分离困难，不能强行一次分离成功，可先用强的松及抗生素治疗一段时间后，再进行分离手术。术后，应同时在宫腔内放置IUD半年。术后使用抗生素预防感染。
术后早期并发症
①术后出血：术后正常的出血量为300ml/第一个24小时，通常仅密切观察，而不做处理。如果超过出血量，或超过24小时仍出血，即诊断为术后出血。出血若发生于术后24小时内，多系术中止血不确切；若发生于术后4〜6天，多由于吻合口黏膜坏死而出血；若发生于术后10〜20天，多由缝线处感染、腐蚀血管所致。绝大多数采用非手术疗法即可止血，保守疗法无效的大出血需再次手术止血。
②十二指肠残端破裂：表现酷似溃疡急性穿孔的临床表现，需立即手术治疗。
③术后肠胃壁缺血坏死、胃肠吻合口破裂或漏：多发生于术后5〜7天，突然有局限性腹膜刺激征表现，或者X线腹部平片在膈下可见游离气体，则可明确诊断，吻合口破裂需立即手术修补，外瘘形成应引流、胃肠减压，必要时手术。
④术后梗阻：
输人段梗阻：又分为急性完全性输入段梗阻，属急性闭袢性梗阻，可发生肠段坏死穿孔，主要表现有上腹部剧烈疼痛，呕吐物不含胆汁，便可诊断，需手术治疗；慢性不完全性输入段梗阻，症状长期不能自行缓解时，可手术；
吻合口梗阻：多因吻合口过小、水肿或内翻过多所致，首先行胃肠减压，消除水肿，通常可以缓解，若上述治疗失败，需再次手术；
输出段梗阻：主要表现有上腹部饱胀，呕吐物含胆汁，X线钡餐确诊后，如不能自行缓解，应急症手术。
⑤术后胃瘫：是胃手术和其他腹部手术后常见的一种并发症，主要是胃排空障碍为主的综合征。主要表现在开始进流质或半流质时，患者出现恶心、呕吐，呕吐物多呈绿色，时间长若未及时补液和调整，易出现水电酸碱紊乱和营养障碍。早期处理主要是置胃管减压和静脉补液，辅助用药为静脉滴注甲氧氯普胺和红霉素，原则上不宜再手术治疗。恢复时间较长。
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